Amikor Beethoven illemtudásbeli hiányosságait a Newton család már nem bírja tovább, a gyerekek titokban beíratják a kutyát egy kutyaiskolába. A történet Koldus és királyfi-féle fordulatot vesz Beethoven-stílusban, amikor egy séta alkalmával Beethoven elkószál a parkban, és összecserélik Michelangelo-val, a tökéletesen beidomított kutyával, aki kiköpött mása kedvenc hősünknek.